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(1).A4ファイル体裁をそのままB6に縮小する方法はありますか?
すみません。縮小して印刷する方法はありますが、体裁自体を変換する方法は、承知しておりません。Word縦書きでA4ファイルをB6ファイルにすると、Wordでの文字数、行指定、行間などがうまく行かない等は、Word側の問題で、A4の原稿があるのであれば、B6に書き写すのが早いのでは?と思います。

(2).A4PDFファイルをそのままKDPに送り、製本のサイズ指定を行った方が良いでしょうか?
上下左右、内側の綴じしろ等の指定は、Wordの時点から調整する必要がありますので、A4のままでは、製本サイズの指定はできても、恐らく余白の指定でエラーとなると思いますので、A4PDFファイルをそのままKDPに送ることはNGだと思います。

私、現在.Word縦書きにてペーパーバック作成中なのですが、Kindle用に作成したA4ファイルをKDPの基本設定に従いB6ファイルにすると、Wordでの文字数と行の指定、行間などが上手く行きません。ルビが消えないようにするため、行間指定で行間を開けると、ページに10行しか入らなくなります。KDPに送るため、A4ファイル体裁を、そのままB6に縮小する方法はありますか？
それともA4PDFファイルのままKDPに送り、製本のサイズ指定を行った方が良いのでしょうか？

大変ご迷惑をおかけいたしますが、お教え頂けますよう、宜しくお願い致します。